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Institut für Pflanzengenetik
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Forschungsgebiet

Die Arbeitsgruppe Markergestützte Selektion beschäftigt sich hauptsächlich mit der Detektion und Kartierung von Genen und QTLs für wichtige Merkmalskomplexe an gartenbaulichen Kulturen und deren biologischen Hintergründen.

Schwerpunkte

  • Markergestützte Kartierung von Resistenzgenen für Echten Mehltau (Podosphaera pannosa) und Sternrußtau (Diplocarpon rosae) an Rosen
  • Evaluierung von Wildarten und Sorten aus der Gattung Rosa in Bezug auf ihre Resistenz gegen pilzliche Pathogene (EU-Projekt GENROSE: Key action 5.1.1)
  • Mikroskopische Studien der Pflanze-Pathogen Interaktion
  • QTL-Analysen für wichtige Merkmale bei Rosen
  • Markergestützte Züchtung bei Phalaenopsis

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Original Publications

Yang, ZB, Eticha, D., Führs, H., Gallien, S., Heintz, D., Van Dorsselaer, A., Schlingmann, B., Rao, I.M., Braun, H.P. & Horst, W.J.  (2013): Proteomic analysis of polyethylene glycol-induced osmotic stress in root tips of common bean (Phaseolus vulgaris L.)., J. Exp. Botany 64, 5569-5586 weitere Informationen

H. Chen, D. Osuna, L. Colville, O. Lorenzo, K. Graeber, H. Küster, G. Leubner-Metzger, I. Kranner (2013): Transcriptome-wide mapping of pea seed ageing reveals a pivotal role for genes related to oxidative stress and programmed cell death, PLoS One 8(10): e78471 (2013) weitere Informationen

Arrieta-Ortiz, M.L., Rodriguez-R., L.M., Perez-Quintero, A.L., Poulin, L., Diaz, A.C., Rojas, N.A., Trujillo, C., Restrepo Benavides, M., Bart, R., Boch, J., Boureau, T., Darrasse, A., David, P., Duge de Bernonville, T., Fontanilla, P., Gagnevin, L., Guerin, F., Jacques, M.-A., Lauber, E., Lefeuvre, P., Medina, C., Medina, E., Montenegro, N., Munoz Bodnar, A., Noel L.D., Ortiz Quinones, J.F., Osorio, D., Pardo, C., Patil, P.B., Poussier, S., Pruvost, O., Robene-Soustrade, I., Ryan, R.P., Tabima, J., Urrego Morales, O.G., Verniere, C., Carrere, S., Verdier, V., Szurek, B., Restrepo, S., Lopez, C., Koebnik, R., Bernal, A. (2013): Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strain CIO151,  PLoS ONE 8, e79704 weitere Informationen
DOI: 10.1371/journal.pone.0079704

Grau, J., Boch, J., and Posch, S. (2013): TALENoffer: genome-wide TALEN off-target prediction. , Bioinformatics 29, 2931-2932. weitere Informationen

Grau, J., Wolf, A., Reschke, M., Bonas, U., Posch, S., and Boch, J.  (2013): Computational predictions provide insights into the biology of TAL effector target sites., PLoS Comp. Biol. 9, e1002962. weitere Informationen

Richter, A. and Boch, J. (2013): Designer TALEs team up for highly efficient gene induction. , Nat. Methods 10, 207-208. weitere Informationen

Streubel, J., Pesce, C., Hutin, M., Koebnik, R., Boch, J., and Szurek, B. (2013): Five phylogenetically close rice SWEET genes confer TAL effector-mediated susceptibility to Xanthomonas oryzae pv. oryzae. , New Phytol. 200, 808-819. weitere Informationen

Streubel, J., Richter, A., Reschke, M., and Boch, J.  (2013): TALEs - Proteine mit programmierbarer DNA-Bindespezifität. , BIOspektrum 19, 370-372. weitere Informationen

Peterhänsel, C., Krause, K., Braun, H.P., Espie, G.S., Fernie, A.R., Hanson, D.T., Keech, O., Maurino, V.G., Mielewczik, M. and Sage, R.F. (2013): Engineering photorespiration: Current state and future possibilities., Plant Biology, in press. weitere Informationen

Hildebrandt, H., Viscomi, C., Di Meo, I, Zeviani, M. and Braun, H.P.  (2013): Proteome adaptations in Ethe1 deficient mice indicate a role in lipid catabolism and cytoskeleton organization via post-translational protein modifications., Biosci. Rep. 33, art:e00052, doi 10.1042/BSR20130051 weitere Informationen

Blume, C., Behrens, C., Eubel, H., Braun, H.P. and Peterhänsel, C.  (2013): A possible role for the chloroplast pyruvate dehydrogenase complex in plant glycolate and glyoxylate metabolism., Phytochemistry 95, 168-176. weitere Informationen

Behrens, C., Blume, C., Senkler, M., Eubel, H., Peterhänsel, C. and Braun, H.P. (2013): The ‘protein complex proteome’ of chloroplasts in Arabidopsis thaliana., J. Proteomics 91, 73-83. weitere Informationen

Kiirikaa, L.M., Stahl, F., Wydra, Kerstin. (2013): Phenotypic and molecular characterization of resistance induction by single and combined application of chitosan and silicon in tomato against Ralstonia solanacearum., Physiological and Molecular Plant Pathology Volume 81, 1–12 weitere Informationen

Borisjuk, L., Neuberger, T., Schwender, J., Heinzel, N., Sunderhaus, S., Fuchs, J., Hay, J.O., Tschiersch, H., Braun, H.P., Denolf, P., Lambert, B., Jakob, P.M. and Rolletschek, H. (2013): Seed architecture shapes embryo metabolism in oilseed rape., Plant Cell 25, 1625-1640. weitere Informationen

Peters K., Belt, K. and Braun, H.P. (2013): 3D gel map of Arabidopsis complex I., Frontiers in Plant Proteomics, doi: 10.2289/fpls.2013.00153 weitere Informationen

Mwangi, J.W., Rode, C., Colditz, F., Haase, C., Braun, H.P. and Winkelmann, T. (2013): Proteomic and histological analyses of endosperm development in Cyclamen persicum as a basis for optimization of somatic embryogenesis., Plant Science 201/202, 52-65. weitere Informationen

C. Hogekamp, H. Küster (2013): A roadmap of cell-type specific gene expression during sequential stages of the arbuscular mycorrhiza symbiosis, BMC Genomics 14(1): 306 weitere Informationen

E. Limpens, S. Moling, G. Hooiveld, P.A. Pereira, T. Bisseling, J.D. Becker, H. Küster (2013): Cell- and tissue-specific transcriptome analyses of Medicago truncatula root nodules, PLoS One 8(5): e64377 weitere Informationen

Kiirika, L., Behrens, C., Braun, H.P. and Colditz, F. (2013): The mitochondrial complexome of Medicago truncatula., Front. Plant Sci., 15 April 2013 | doi: 10.3389/fpls.2013.00084 weitere Informationen

L. Ubayasena, P. Vijayan, K.E. Bett, G.R. Gray, H. Küster, T.D. Warkentin  (2013): Gene expression profiles of seed coats and biochemical properties of seed coats and cotyledons of two field pea (Pisum sativum) cultivars contrasting in green cotyledon bleaching resistance, Euphytica 193(1): 49-65

Noah, A.M., Niemenak, N., Sunderhaus, S., Haase, C., Omokolo1, D.N., Winkelmann, T. and Braun, H.P. (2013): Comparative proteomic analysis of early somatic and zygotic embryogenesis in Theobroma cacao L. , J. Proteomics 78, 123-133. weitere Informationen

Behrens, C., Hartmann, K., Sunderhaus, S., Braun, H.P. and Eubel, H. (2013): Theoretical and experimental analysis of native isoelectric points of membrane protein complexes of Arabidopsis chloroplasts and mitochondria., Biochim. Biophy. Acta (Biomembranes) 1828, 1036–1046. weitere Informationen

Nietzel, T., Dudkina, N.V., Haase, C., Denolf, P., Semchonok, D., Boekema, E.J., Braun, H.P., Sunderhaus, S. (2013): The native structure and composition of the Cruciferin complex in Brassica napus., J. Biol. Chem. 288, 2238–2245 weitere Informationen

Hauler, A., Jonietz, C., Stoll, B., Stoll, K., Braun, H.P. and Binder, S. (2013): RNA PROCESSING FACTOR 5 is required for efficient 5’ cleavage at a processing site conserved in RNAs of three different mitochondrial genes in Arabidopsis thaliana. , Plant J. 74(4):593-604 weitere Informationen

Huang, S., Shingaki-Wells, R.N., Taylor, N.L. and Millar, A.H. (2013): The rice mitochondria proteome and its response during development and to the environment., Front. Plant Sci. weitere Informationen

Bussell JD, Behrens C, Ecke W, Eubel H. (2013): Arabidopsis peroxisome proteomics., Front Plant Sci. 2013 Apr 24;4:101. doi: 10.3389/fpls.2013.00101. eCollection 2013. weitere Informationen

Zareie R, Eubel H, Millar AH, Baer B. (2013): Long-term survival of high quality sperm: insights into the sperm proteome of the honeybee Apis mellifera., J Proteome Res. 2013 Nov 1;12(11):5180-8. doi: 10.1021/pr4004773. weitere Informationen

Klie, M, Ina Menz, I, Linde, M. and Debener, T (2013): Lack of structure in the gene pool of the highly polyploid ornamental chrysanthemum., Molecular Breeding 32: 339-348.

Yasmin, A. ;Jalbani, A.A.; Ali, M.; Nasreen, A.; and Debener, T. (2013): Development of Agrobacterium-based transient gene expression assay in rose leaves., Pakistan Journal of Botany 45: 1005-1009

Book Articles

H. Küster (2013): Medicago truncatula, In S. Maloy, K. Hughes K (eds): Brenner’s Encyclopedia of Genetics, 2nd edition, p. 335-337. Academic Press, San Diego

Other Publications

Kleinhammer, C. and Braun, H.P.  (2013): Mehr Geld für den Nachwuchs., Transkript Vo1. 19, Heft Nr. 8-9, p 74.

Braun, H.P.  (2013): An outside perspective on the Centre for Plant Energy Biology (PEB)., Centre for Plant Energy Biology, Annual Report 2012, p 36.

Braun, H.P.  (2013): Tagungsbericht: 18th Lorne Proteomics Symposium, Australia., Transkript Vol. 19, Heft 4, p 43.